Publications S. Fiorucci

Complete list of peer-reviewed publications:

[43] More than just smell – COVID-19 is associated with severe impairment of smell, taste, and chemesthesis. Global Consortium of Chemosensory Research*. 2020, Chem. Senses, in press. DOI.
* From the Chemosim Lab : C. Bouysset, S. Fiorucci & J. Golebiowski.

[42] Novel scaffold of natural compound eliciting sweet taste revealed by machine learning. C. Bouysset, C. Belloir, S. Antonczak, L. Briand, S. Fiorucci. 2020, Food Chem. available online.

[41] Molecular insights into the structure-function relationships of bitter taste receptors. C. Bouysset, J. Topin, Y. Wang, P. Jiang, J. Golebiowski, S. Antonczak, S. Fiorucci. 2020, Chem. Senses, 45, 153. DOI

[40] Machine learning decodes chemical features to identify novel agonists of a moth odorant receptor. G. Caballero-Vidal, C. Bouysset, H. Grunig, S. Fiorucci, N. Montagné, J. Golebiowski, E. Jacquin-Joly. Sci. Rep, 2020, 1655. DOI

[39] Allosteric modulation mechanism of the mGluR5 transmembrane domain.
X. Cong, J.B. Chéron, J. Golebiowski, S. Antonczak, S. Fiorucci. J. Chem. Info. Model., 2019, 59(6), 2871-2878. DOI

[38] Metal ions activate the human TAS2R7 receptor.
Y. Wang, A.L. Soohoo, W. Lei, R.F. Margolskee, C. Bouysset, J. Golebiowski, H. Zhao, S. Fiorucci, P. Jiang. Chem. Senses, 2019, 44, 339-347. DOI

[37] Zebrafish Olfactory Receptors ORAs Differentially Detect Bile Acids and Bile Salts.
X. Cong, Q. Zheng, W. Ren, J.B. Cheron, S. Fiorucci, T. Wen, C. Zhang, H. Yu, J. Golebiowski, Y. Yu., J. Biol. Chem.2019, 294, 6762-6771.  DOI

[36] Conserved residues control the T1R3-specific allosteric signaling pathway of the mammalian sweet taste receptor.
J.B. Chéron, A. Soohoo, Y. Wang, J. Golebiowski, S. Antonczak, P. Jiang, S. Fiorucci. Chem. Senses,  2019, 44, 303-310. DOI

[35] Natural Sweeteners.
J.B. Chéron, A. Marchal, S. Fiorucci. In: Melton, L., Shahidi, F., Varelis, P. (Eds.), Encyclopedia of Food Chemistry, vol. 1, 2019, pp. 189–195. Elsevier. DOI

[34] Activation dynamics of the neurotensin G-protein coupled receptor 1.
X. Cong, S. Fiorucci, J. Golebiowski. J. Chem. Theory Comput., 2018, 14(8), 4467-4473. DOI

[33] Agonists of G Protein-Coupled Odorant Receptors are Predicted from Chemical Features.
C. Bushdid, C.A. de March, S. Fiorucci, H. Matsunami, J. Golebiowski. J. Phys. Chem. Lett. 2018, 9, 2235-2240. DOI

[32] Design, Synthesis and Photophysical Studies of Styryl-Based Push-Pull Fluorophores with Remarkable Solvatofluorochromism.
M. Safir Filho, S. Fiorucci, A. Martin, R. Benhida. New J. Chem. 2017, 41, 13760-13772. DOI

[31] Update of the ATTRACT force field for the prediction of protein-protein binding affinity.
J.B. Chéron, M. Zacharias, S. Antonczak, S. Fiorucci. J. Comput. Chem. 2017, 38(21), 1887-1890. DOIWEBSERVER

cover-AC-416_small
(cover l’Actualité chimique mars 2017)

[30] Ces molécules qui éveillent nos papilles.
J.B. Chéron, J. Golebiowski, S. Antonczak, L. Briand, S. Fiorucci. L’Actualité Chimique, 2017, 416, 11-18. Abstract

[29] Bornyldiphosphate synthase from Lavandula angustifolia: a major monoterpene synthase involved in essential oil quality.
Y. Despinasse, S. Fiorucci, S. Antonczak, S. Moja, A. Bony, F. Nicolè, S. Baudino, J.L. Magnard, F. Julien. Phytochemistry, 2017, 137, 24-33.  DOI

[28] The anatomy of mammalian sweet taste receptors.
J.B. Chéron, J. Golebiowski, S. Antonczak, S. Fiorucci. Proteins, 2017, 85, 332-341. DOI

[27] Sweetness prediction of natural compounds.
J.B. Chéron, J. Golebiowski, S. Antonczak, S. Fiorucci. Food Chem. 2017, 221, 1421-1425. DOI

[26] The anatomy of mammalian sweet taste receptors.
J.B. Chéron, J. Golebiowski, S. Antonczak, S. Fiorucci. Chem. Senses 2016, 41(9), E179-E179. DOI

[25] Structure-function of Odorant and Sweet-taste Receptors Based on Molecular Modeling.
J. Golebiowski, J.B. Chéron, C.A. De March, S. Fiorucci, S. Antonczak, Chem. Senses 2016, 41(7), E83-E83. DOI

[24] Fine-tuning of microsolvation and hydrogen bond interaction regulates channeling in the course of flavonoid biosynthesis.
J. Diharce, J. Golebiowski, S. Fiorucci, S. Antonczak. Phys. Chem. Chem. Phys. 2016, 18, 10337-10345. DOI

[23] Deciphering the odorant binding protein-olfactory receptor interactions.
M. Viano, S.K. Kim, W.A. Goddard III, C.A. de March, J. Golebiowski, S. Fiorucci. Chem. Senses, 2015, 40, 242. DOI

[22] Advances in GPCR Modeling Evaluated by the GPCR Dock 2013 Assessment: Meeting New Challenges.
I. Kufareva, V. Katritch, Participants of GPCR Dock 2013#,R.C. Stevens, R. Abagyan. Structure. 2014, 22, 1120-1139. DOI

#among them: UNICE group involving C.A. De March, J. Diharce, S. Antonczak, J. Golebiowski, S. Fiorucci

cover_book_immunoinformatics

[21] Chap. 20: Computational antigenic epitope prediction by calculating electrostatic desolvation penalties of protein surface.
S. Fiorucci, M. Zacharias. in Immunoinformatics, R.K. De, N. Tomar, Springer (2014) p.365-374 Contents / DOI

[20] O2 migration rates in [NiFe]hydrogenases. A joint approach combining free-energy calculations and kinetics modeling.
J. Topin, J. Diharce, S. Fiorucci, S. Antonczak, J. Golebiowski. J. Phys. Chem. B, 2014, 118, 676-681. DOI

cover_PMB (cover PMB 2014 vol. 84)

[19] Isolation and functional characterization of a t-cadinol synthase, a new sesquiterpene synthase from Lavandula angustifolia.
F. Julien, S. Moja, A. Bony, S. Legrand, C. Petit, T. Benabdelkader, K. Poirot, S. Fiorucci, Y. Guitton, F. Nicole, S. Baudino, J.L.Magnard. Plant Mol. Biol., 2014, 84, 227-241. DOI

[18] In vivo characterization of dynein-driven nanovectors using Drosophila oocytes.
N. Parassol, C. Bienvenu, C. Boglio, S. Fiorucci, D. Cerezo, X.M. Yu, G. Godeau, J. Greiner, P. Vierling, S. Noselli, C. Di Giorgio, V. Van de Bor. PlosOne, 2013, 8, e82908 DOI

cover_book-flavorsci

[17] Chap. 96: Molecular features underlying the chemoreception of odorant binding proteins and olfactory receptors. Insights from molecular modeling and biophysical data. J. Golebiowski, L. Charlier, J. Topin, S. Fiorucci, S. Antonczak in Flavour Sciences, V. Ferreira, R. Lopez, Academic Press (2013) p.519-523 Contents

cover-medium.gif

[16] Chap.15 : ATTRACT and PTools: Open sources programs for protein-protein docking.
S. Schneider, A. Saladin, S. Fiorucci, C. Préviost, M. Zacharias. in Computational Drug Discovery and Design, R. Baron, Springer (2012) p.221-232 Contents / DOI

[15] Molecular features underlying the perception of astringency as probed by molecular modeling.
J. Golebiowski, S. Fiorucci, M. Adrian-Scotto, J. Fernandez-Carmona, S. Antonczak, Mol. inf., 2011, 30, 410-414. DOI

[14] Exploiting antigenic diversity for vaccines design: the Chlamydia ArtJ paradigm.
M. Soriani, P. Petit, R. Grifantini, R. Petracca, G. Gancitano, E. Frigimelica, F. Nardelli, C. Garcia, S. Spinelli, G. Scarabelli, S. Fiorucci, R. Affentranger, M. Ferrer-Navarro, M. Zacharias, G. Colombo, L. Vuillard, X. Daura and G. Grandi, J. Biol. Chem, 2010, 285, 30126-30138 DOI

[13] Binding site prediction and improved scoring during flexible protein-protein docking with ATTRACT.
S. Fiorucci, M. Zacharias, Proteins, 2010, 78(15), 3131-3139 DOI

[12] Prediction of protein-protein interaction sites using electrostatic desolvation profile.
S. Fiorucci, M. Zacharias, Biophys. J., 2010, 98(9), 1921-1930 DOI

cover_bookchapterDG

[11] Chap.11:  Prediction/calculation of protein-protein binding affinities and mutation effect.
S. Fiorucci, S. Antonczak, J. Golebiowski. in Protein-protein complexes: Analysis, modeling and drug design, M. Zacharias, Wolrd Scientific (2010) p.295-317 Contents / DOI

highlyaccessed-large

[10]. PTools: an opensource molecular docking library.
A. Saladin, S. Fiorucci, P. Poulain, C. Prevost, M. Zacharias. BMC Struct. Biol., 2009, 9, 27 DOI

[9]. Theoretical Investigations of the Role Played by Quercetinase Enzymes upon Flavonoids Oxygenolysis Mechanism.
S. Antonczak, S. Fiorucci, J. Golebiowski, D. Cabrol-Bass, Phys Chem Chem Phys, 2009, 11, 1491-1501. DOI

[8]. Enzymatic Mechanisms involving Flavonoïds: a Theoretical Point of View.
S. Antonczak, S. Fiorucci, J. Golebiowski, D. Cabrol-Bass. Proceedings of the XXIV International Congress on Polyphenol, Salamanques (Espagne), 8-11 Juillet 2008.

[7]. Molecular simulations enlighten the binding mode of quercetin to lipoxygenase-3.
S. Fiorucci, J. Golebiowski, S. Antonczak, D. Cabrol-Bass. Proteins, 200873, 290-298. DOI

[6]. Binding free energy predictions in strongly hydrophobic biomolecular systems.
L. Charlier, C. Nespoulous, S. Fiorucci, S. Antonczak, J. Golebiowski. PhysChemChemPhys, 2007, 9, 5761-5771. DOI

[5]. Mechanistic events underlying Odorant Binding Protein chemoreception.
J. Golebiowski, S. Antonczak, S. Fiorucci, D. Cabrol-Bass. Proteins, 2007, 67, 448-458. DOI

[4]. DFT Study of quercetin activated forms involved in antioxidant and prooxidant biological processes.
S. Fiorucci, J. Golebiowski, D. Cabrol-Bass, S. Antonczak. J Agr Food Chem, 2007, 55(3), 903-911. DOI

[3]. Molecular Simulations bring new insights into Flavonoid/Quercetinase Interaction Modes.
S. Fiorucci, J. Golebiowski, D. Cabrol-Bass, S. Antonczak. Proteins, 2007, 67(4), 961-970. DOI

[2]. Molecular simulation reveal a new entry site in Quercetin 2,3-Dioxygenase. A pathway for Dioxygen?
S. Fiorucci, J. Golebiowski, D. Cabrol-Bass, S. Antonczak. Proteins, 2006, 64, 845-850. DOI

[1]. Oxygenolysis of flavonoid compounds. DFT description of the mechanism for the quercetin case.
S. Fiorucci, J. Golebiowski, D. Cabrol-Bass, S. Antonczak. Chemphyschem, 2004, 5, 1726-1733. DOI

Invited conferences :

[10]. Décrypter le code des odeurs. S. Fiorucci. Journée « De la Fleur aux Parfums » : Nouvelles Technologies, Intelligence Artificielle & Big Data Pôle PASS-Terralia, Grasse, 26 novembre 2019.

[9]. Prédictions in silico de ligands actifs sur les récepteurs olfactifs du papillon de nuit Spodoptera littoralis. G. Caballero-Vidal, C. Bouysset, S. Fiorucci, N. Montagné, J. Golebiowski, E. Jacquin-Joly. Club de Biologie de l’Insecte, Albi, 26-28 juin 2019

[8]. Artificial intelligence models predict chemosensory percepts. S. Fiorucci, Symposium UCA-Monell, Philadelphie (US), 14 mars 2019.

[7]. Artificial Intelligence & Chemical Senses. S. Fiorucci, 4e réunion du GDR Odorant-Odeur-Olfaction (GDRO3), Nice, 3-4 décembre 2018.

[6]. Chimioréception de la saveur sucrée. S. Fiorucci, journée SweetFlavor du pôle de compétitivité PASS, Aix-en-provence, 9 octobre 2018.

[5]. Bases moléculaires de la perception chimiosensorielle. S. Fiorucci. Colloque ARET 2018. Dijon, 28-29 mai 2018.

[4]. Modelling of a metabolon involved in flavonoid biosynthesis : theoretical strategies. J. Diharce, S. Fiorucci, J. Golebiowski, S. Antonczak. 7ès Journées Franco-Italiennes de Chimie. 7Th JFIC-GCIC, Turin (Italie), 5-6 mai 2014.

[3]. Contribution de la modélisation moléculaire à la compréhension de la perception olfactive. S. Fiorucci. Journée interdisciplinaire Thématique Odorant-Odeurs-Olfaction, Université de Nice-Sophia Antipolis, 4 juillet 2013

[2]. Multiresolution approaches for modeling biomolecular complexes. S. Fiorucci. Computational Challenges in Structural Biology, ESBS, Strasbourg, 14-15 novembre 2012

[1]. Prediction of protein-protein interface using electrostatic profile. S. Fiorucci. Flexibility and Biological Recognition: from Biophysics to Data Models, INRIA Sophia Antipolis Méditerranée, 18-20 mars 2009

Oral communications :

[22]. Decoding sweet taste from chemical structures. C. Bouysset, C. Belloir, L. Briand, S. Antonczak, S. Fiorucci. SFCi2019, Paris, 21-22 novembre 2019.

awards Prix de la meilleure communication orale [22]

[21]. Reverse chemical ecology expands the list of ligands for a crop pest insect odorant receptor. G. Caballero-Vidal, C. Bouysset, S. Fiorucci, N. Montagné, J. Golebiowski, E. Jacquin-Joly. XI EBEQ, Brazilian meeting on chemical ecology, Maceio (Brésil), 23-26 Oct. 2019.

awards Prix des 3 meilleures communications orales [21]

[20] Exploring the odor space of Spodoptera littoralis larvae. G. Caballero-Vidal, C. Bouysset, S. Fiorucci, J. Golebiowski, C. Meslin, C. Monsempès, M.C. François, N. Montagné, E. Jacquin-Joly. European Symposium on Insect Taste and Olfaction, Villasimius (Italie),15-20 sept 2019

[19] Mechanism of GPCR activation triggered by ligands, mutations and protonation. X. Cong, J.B. Chéron, S. Antonczak, S. Fiorucci, J. Golebiowski. GGMM2019. Nice, 3-5 avril 2019.

[18] Modèle numérique des relations structure-saveur. C. Bouysset, S. Antonczak, S. Fiorucci. GGMM2019. Nice, 3-5 avril 2019.

[17]. Sweet taste receptor: from sequence to structure. J.B. Chéron, J. Golebiowski, S. Antonczak, S. Fiorucci. JFIC2016. Avignon, 25-26 avril 2016.

[16]. Etude de relations structure-activité du récepteur au goût sucré. J.B. Chéron, J. Golebiowski, S. Antonczak, S. Fiorucci, 7e journées de la Société Française de Chémoinformatique, Nice, 8-9 octobre 2015.

awards Prix de la meilleure communication orale [16]

[15]. Description théorique d’un phénomène de “substrate channeling” dans la biosynthèse de flavonoïdes. J. Diharce, J. Golebiowski, S. Fiorucci, S. Antonczak. GGMM & GT Enzyme 2015, Sète, 25-28 mai 2015.

[14]. Modelling of a metabolon involved in Flavonoid biosynthesis. J. Diharce, J. Golebiowski, S. Fiorucci, S. Antonczak. 27th International Conference on Polyphenols. Nagoya (Japon), 2-6 septembre 2014

[13]. Biosynthèse des flavonoïdes : une étude QM/MM MD de l’étape impliquant l’enzyme DFR. J. Diharce, J. Golebiowski, S. Fiorucci, S. Antonczak. 14e journée francophones des jeunes physico-chimistes. Fréjus, 14-18 octobre 2013.

[12]. Modelling of a metabolon involved in flavonoid biosynthesis. J. Diharce, S. Fiorucci, S. Antonczak. 7th international Workshop on antocyanins. Porto (Portugal), 9-11 septembre 2013.

[11]. Theoretical strategies for the modelling of a metabolon involved in flavonoid biosynthesis. J. Diharce, S. Fiorucci, S. Antonczak. 6th Theoretical Biophysics Symposium (Theobio2013). Gothenburg (Suède), 24-26 juin 2013.

[10]. Mécanismes enzymatiques de la production des anthocyanes: une étude par dynamique moléculaire QM/MM de l’étape impliquant DFR. J. Diharce, S. Fiorucci, I. Tunon, S. Antonczak. 18e congrès GGMM. Saint Pierre d’Oléron, 21-23 mai 2013.

[9]. Experimental and theoretical charaterization of macromolecular assemblies at low resolution. S. Fiorucci. Discussion meeting CFCAM, IBPC Paris, 8-9 april 2013

[8]. Modeling ligand-receptor interactions at the molecular level. Molecular dynamics used as a computational microscope to decipher the sense of smell. J. Golebiowski, L. Charlier, J. Topin, S. Fiorucci, S. Antonczak. 1er Congrès International ISI, Meknès (Maroc), 1-5 juin 2011

[7]. Enseigner la Chimie théorique en Licence ou comment profiter des ressources numériques et computationelles en la matière. J. Golebiowski, S. Fiorucci, S. Antonczak. 27e JIREC, 14e MIEC, Paris (France), 24-27 mai 2011.

[6]. Electrostatic profiles of targets NMB0033 and CT043. S. Fiorucci, M. Zacharias. Bacabs EU project meeting, Milan (Italie), 10 et 11 Mars 2008.

[5]. Antigen/Antibody docking improvement including hotspot and solvation energy. S. Fiorucci, M. Zacharias. Bacabs EU project meeting, Barcelone(Espagne), 18 Janvier 2008.

[4]. Le mécanisme d’oxygénolyse de flavonoïdes : une synergie entre enzyme et substrat. S. Fiorucci, J. Golebiowski, D. Cabrol-Bass, S. Antonczak. 10ème Rencontre des chimistes théoriciens Francophones, Nancy (France), 10-13 Juillet 2006.

[3]. Un nouveau site d’entrée dans l’enzyme Quercetin 2,3-Dioxygénase révélé par simulations de dynamique moléculaire : un canal pour le dioxygène? S. Antonczak, S. Fiorucci, J. Golebiowski, D. Cabrol-Bass. 3ème rencontre du Club Métalloprotéines et Modèles, Carry-Le-Rouet (France), 2-5 Octobre 2005.

[2]. Oxygenolysis of flavonoid compounds. Theoretical mechanism description for the quercetin case. S. Antonczak, S. Fiorucci, J. Golebiowski, D. Cabrol-Bass. 5th European Conference on Computational Chemistry (EuCo-CC5), La Londe les Maures (France), 15-20 Juin 2004.

[1]. Oxygénolyse de flavonoïdes : Etudes DFT du cas de la quercétine. S. Fiorucci, J. Golebiowski, D. Cabrol-Bass, S. Antonczak. 7ème journée Francophone des Jeunes Physico-Chimistes, Monastir (Tunisie) 19-21 mars 2004.

Invited seminars:

[10]. Chimioréception de la saveur sucrée. S. Fiorucci. ICSN (UPR 2301 CNRS), Gif s/Yvette, 19 septembre 2019.

[9]. Sweet taste chemoreception. S. Fiorucci. Food Polyphenol Lab, Porto, 28 mai 2019.

[8]. Sweet taste chemoreception. S. Fiorucci. Laboratoire de Biologie Fonctionelle et Adaptative (UMR 8251 CNRS), Paris, 10 juillet 2018.

[7]. Modèle numérique de la perception des saveurs. S. Fiorucci. Jean Niel (SAS), Grasse, 25 septembre 2018.

[6]. Prédiction de la structure de complexes protéine-protéine. S. Fiorucci. Séminaire PIRAMID organisé par le CEISAM (UMR 6230 CNRS), Nantes, 5 juillet 2016.

[5]. Molecular modeling of the sweet taste receptor. J.B. Chéron, J. Golebiowski, S. Antonczak, S. Fiorucci. UFIP UMR 6286 CNRS, Nantes, 14-15 juin 2016

[4]. Apport de la modélisation moléculaire à l’étude des sens chimiques: le récepteur au goût sucré. S. Fiorucci. CSGA (UMR INRA, CNRS & Univ. Bourgogne), Dijon, 28 janvier 2016.

[3]. PTools: an opensource molecular docking library. S. Fiorucci. IPMC UMR 7275, Université de Nice-Sophia Antipolis, 20 octobre 2009.

[2]. Mécanismes antioxydants et antiradicalaires impliquant des flavonoïdes. S. Antonczak, S. Fiorucci, J. Golebiowski, D. Cabrol-Bass. Réseau INPL « Fonctionnalisation de molécules pour des applications biologiques », Nancy, le 22 mai 2006.

[1]. Etude DFT du Mécanisme d’Oxydation de la Quercétine par le Dioxygène. S. Antonczak, S. Fiorucci, J. Golebiowski, D. Cabrol-Bass. UMR CNRS 5516, ENSSPICAM, Faculté des Sciences de St Jérôme, Marseille, le 25 septembre 2003.

Public & School Conferences :

  • Projet « Analyse sensorielle – arôme fraise », lycée Amiral de Grasse, 2019 & 2020, Grasse
  • Conférence Grand Public, « Cinq saveurs, sept milliards de goûteurs », semaine Pint of Science 2018, Nice.
  • Conférence Grand Public, « Le goût du futur », semaine du cerveau 2018, Grasse
  • Conférence Grand Public, « cinq saveurs, sept milliards de goûteurs », semaine du cerveau 2017, Grasse
  • Conférence Grand Public, « de la molécule au goût », semaine du cerveau 2016, Grasse
  • Parrainage d’élèves 6e-5e, action Univercités sur un projet autour du « sens du goût » organisé par l’association « les petits débrouillards », 2014, Nice
  • Conférence, Scolaire, « quand la chimie a du nez », fête de la science 2012, Grasse
  • Film de vulgarisation « Au cœur de la matière », fête de la science 2011, Nice
  • Conférence, Gd Public « Sherlock Holmes et la chimie », fête de la science 2011, Grasse.